A educação baseada em competências enfrenta desafios de avaliação eficaz, especialmente em currículos integrados dos cursos de medicina. A Avaliação Formativa se torna crucial nesses novos currículos. Realizou-se um estudo descritivo, longitudinal e prospectivo com a aplicação de instrumento validado para acompanhamento do processo de avaliação formativa em curso de medicina com currículo baseado em competências. O instrumento foi aplicado a 80 discentes em sessões tutoriais e 87 em habilidades clínicas. Observou-se alta confiabilidade (índice alpha de 0,940) e usabilidade (SUS de 91,9 para sessões tutoriais e 81,6 para habilidades clínicas). Houve correlação significativa entre diversos itens dos instrumentos para sessão tutorial e habilidades clínicas com a avaliação formativa (18 e 11 itens) e o desfecho acadêmico (10 itens), o que diferiu da correlação com a avaliação somativa (2 e 1 item). Os instrumentos demonstram potencial para o acompanhamento da avaliação formativa e identificação precoce de dificuldades acadêmicas e atitudinais dos discentes. Sua implementação pode melhorar desenvolvimento de competências dos estudantes, fornecendo insights importantes para a gestão acadêmica.