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Dulce Cecilia García Martínez, Alfonso Vázquez López, Victoria Ayala Escobar, Cristian Nava Díaz, Sergio Aranda Ocampo
Pseudomonasfluorescentes yBacillusspp. se encuentran entre las bacteriascon mayor potencial para el control biológico de enfermedades en plantas. Los objetivos deesta investigación fueron: i) identificar especies dePseudomonasfluorescentes yBacillusde la rizósfera de agaves silvestres antagonistas de bacterias pectinolíticas, y ii) detectarla presencia de genes para la biosíntesis de lipopéptidos antimicrobianos (AMPs) en lascepas antagonistas. Se evaluó el índice de eficiencia antagonista (IEA)in vitrode 109 cepasdePseudomonasfluorescentes y 119 deBacillusspp. aisladas de la rizósfera de agavessilvestre contra cinco cepas bacterianas pectinolíticas de los génerosPectobacteriumyDickeya. Por PCR, las bacterias antagonistas se identificaron por secuenciación del gen 16SrRNA y se detectaron los genes AMPs: fenD (fengicina), ituC (iturina), srfAA (surfactina),y bmy (bacilomicina) paraBacillusspp.; prnD (pirrolnitrina) y phlD (2,4 diacetilfloroglucinol)paraPseudomonasfluorescentes con iniciadores específicos. Los resultados del IEAin vitroresultó en la selección de 25 cepas antagonistas contra una o más bacterias pectinolítcas. Lacomparación de las secuencias del gen 16S rRNA identificaron 11 (44%) cepas en el géneroBacillusy 14 (56%) enPseudomonascon similitud entre el 97 y 100%. Entre las especiesdeBacillusyPseudomonas, la mayoría albergó entre dos a cuatro genes AMPs. Los genesItuC, srfAA y phlD fueron de mayor frecuencia en todas las cepas antagonistas; en las cepasBacillus subtilis(9B14) yPseudomonas fluorescens(G3, D4 y H6) se detectaron todos losgenes evaluados.
FluorescentPseudomonasandBacillusspp.are among the bacteriawith the greatest potential for the biological control of plant diseases. The objectives ofthis research were: i) to identify fluorescentPseudomonasandBacillusspecies from therhizosphere of wild agaves antagonists of pectinolytic bacteria, and ii) to detect the presenceof genes for the biosynthesis of antimicrobial lipopeptides (AMPs) in the antagonist strains.Thein vitroantagonist efficiency index (IEA) of 109 strains of fluorescentPseudomonasand119 ofBacillusspp. isolated from the rhizosphere of wild agaves against five pectinolyticbacterial strains of the generaPectobacteriumandDickeyawere evaluated.By PCR,antagonistic bacteria were identified by sequencing the 16S rRNA gene and AMPs genes:fenD (fengicin), ituC (iturin), srfAA (surfactin), and bmy (bacillomycin) forBacillusspp.,prnD (pyrrolnitrin), and phlD (2,4-diacetiylphloroglucinol) for fluorescentPseudomonasweredetected with specific primers. Thein vitroIEA resulted in the selection of 25 antagoniststrains against one or more pectinolytic bacteria.Comparison of the 16S rRNA genesequences identified 11 (44%) strains in theBacillusgenus and 14 (56%) inPseudomonaswith similarities between 97 and 100%. Among theBacillusandPseudomonasspecies, mostharbored between two to four AMPs genes. The ItuC, srfAA, and phlD genes were morefrequent in all antagonist strains; all the genes evaluated were detected in theBacillus subtilis(9B14) andPseudomonas fluorescens(G3, D4, and H6) strains.
