En el contexto actual, la información, el conocimiento y la innovación son factores indispensables para la sociedad, la economía, el desarrollo territorial y organizacional. Por tales razones Cuba ha implementado desde 1995 un Sistema de Ciencia, Tecnología e Innovación con el propósito de lograr la vinculación entre la comunidad científica / la comunidad empresarial y el gobierno. Con la finalidad de conocer las capacidades y limitaciones que tienen las estructuras del Ministerio de Ciencia, Tecnología y Medio Ambiente de Pinar del Río para gestionar el conocimiento, se realizó un diagnóstico utilizando el método científico histórico - lógico y el dialéctico para conocer los fundamentos históricos que existen sobre la Gestión del Conocimiento y su articulación en el Sistema de Ciencia, Tecnología e Innovación. Se aplicó un cuestionario para la recolección de los datos y el análisis documental que comprendió el estudio de textos de la especialidad y de las principales experiencias reportadas. Los principales resultados muestran que estas organizaciones no logran transferir con efectividad la información, el conocimiento y las innovaciones disponibles en la comunidad académica hacia la comunidad empresarial. Se propone un programa de acciones que contempla el diseño de un modelo de gestión del conocimiento, crear capacidades para el trabajo en red, renovar el conocimiento, articular la estrategia de comunicación social que permita una mayor visibilidad y fomentar el desarrollo del potencial científico en función de las prioridades del territorio.