En el caso de los niños desaparecidos de Córdoba han existido diversas circunstancias, tales como discrepancia en las conclusiones contenidas en el primer informe pericial y los posteriores, que han motivado un interés y preocupación sobre las normas de investigación y prueba aplicables en nuestro sistema procesal penal. De especial interés está siendo el debate sobre las garantías y valor probatorio que ofrece la prueba pericial científica de tanta importancia en los últimos tiempos. A estas cuestiones y a la reflexión sobre el sistema de proceso penal español y especialmente sobre la prueba científica está referido este artículo.