En este trabajo se discuten algunas cuestiones metodológicas surgidas en el marco de una serie de investigaciones sobre la historia de la enseñanza de las ciencias naturales. Se revisan tres problemas de este tipo de investigaciones: la adecuación de las herramientas de la historia para el estudio de la educación; la pertinencia de un enfoque "historizante" en el abordaje de los discursos pedagógicos; y el problema de las periodizaciones en la historia de la educación. Avanzamos respuestas preliminares a estos problemas tomadas de reconocidos historiadores de la educación.