En este artículo se presentan los resultados derivados de la evaluación del desempeño docente de los académicos del Departamento de Biología Marina de la Universidad Autónoma de Baja California Sur. En este estudio se conjuntaron metodológicamente los enfoques cuantitativo y cualitativo de investigación educativa. Comprendió un periodo de seis semestres, desde 1996-II hasta 1999-I, se evaluó el quehacer de los profesores en la fase interactiva del proceso enseñanza-aprendizaje, a través de un Cuestionario de evaluación de la docencia por los alumnos (CEDA). Los resultados se analizaron estadísticamente. Además se entrevistó a profesores y alumnos de la carrera, las entrevistas fueron analizadas y los resultados obtenidos se conjuntaron con los estadísticos.