A partir de las experiencias obtenidas en dos recientes estudios cienciométricos sobre transferencia de tecnología, se dan a conocer algunas de las aplicaciones que ofrece el análisis de la literatura científica citada en documento de patente, así como las limitaciones y dificultades metodológicas que presenta este tipo estudios. Este artículo describe el procedimiento metodológico utilizado para analizar el flujo de información científica generada y publicada por los investigadores de nuestro sistema público de I+D que ha servido de base para el desarrollo de patentes nacionales y extranjeras. La metodología aquí descrita permite obtener una serie de indicadores para determinar las verdaderas capacidades de nuestras universidades y centros de investigación para producir conocimientos potencialmente utilizables por el sector productivo, para incrementar la generación de patentes, impulsar la transferencia de tecnología y la cooperación con la industria y promover la creación de nuevas empresas de base tecnológica.