Efemérides Mexicana salió a la luz en 1983 (un año después de la reapertura de la Universidad Pontificia de México [1982]) y surgió como “una respuesta inmediata a la necesidad de difundir el pensamiento científico de la Universidad […] un medio con el cual se pueda poner este centro de estudios en diálogo con los distintos individuos e instituciones que se dedican a cultivar las ciencias en nuestro mundo”.
Su primer nombre fue sencillamente Mexicana y se consolidó como Efemérides Mexicana a partir de su cuarto número, mismo que conserva hasta nuestros días.
Efemérides Mexicana busca dar a conocer a la comunidad universitaria nacional e internacional, así como a diferentes especialistas e investigadores en las materias de Teología, Filosofía e Historia, la producción intelectual de la universidad. Difundiendo de esta manera, el pensamiento científico católico de la institución y las aportaciones o investigaciones de especialistas.