El presente trabajo pretende explicar y valorar críticamente los aspectos más relevantes de la regulación y la jurisprudencia del TJUE relativos al procedimiento que debe observar la Administración de la UE (principalmente, la Comisión y las agencias europeas) cuando ejecuta el Derecho de la Unión de forma directa o conjunta con las Administraciones de los Estados miembros. Pone un especial énfasis en aquellos elementos que resultan de particular interés desde la perspectiva del Derecho administrativo español, y que son muchos. Concluye que, aunque la regulación vigente presente numerosos aspectos innovadores y el TJUE confiera una tutela judicial del máximo nivel, sería conveniente aprobar la codificación general que vienen reclamando con insistencia la doctrina y el Parlamento Europeo desde hace unos años.