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Luis Enrique Sánchez Ramos
, Gaspar Manuel Parra Bracamonte, Ana María Sifuentes Rincón, Juan Carlos Martínez González, Juan Gabriel Magaña Monforte, José Fernando Vázquez Armijo, Xochitl Fabiola De la Rosa Reyna, Victor Ricardo Moreno Medina
RESUMEN.En ganado bovino la vía AMPK actúa como un sensor energético que se activa por aumentos en la proporción celular AMP/ATP e influye sobre múltiples procesos metabólicos modificando el perfil de ácidos grasos (FA) en distintos tejidos. El objetivo del trabajo fue estimar y comparar las frecuencias alélicas de 27 SNP en 22 genes de la ruta AMPK, en poblaciones de ganado Wagyu y sus cruces. Se colectaron 111 muestras de Longissimus dorside Wagyu y Wagyu-Cross, las cuales se agruparon por grupo genético, para tipificar 27 SNP ubicados dentro de los 22 genes que participan en la ruta AMPK. Se examinó el desequilibrio de ligamiento, el equilibrio de Hardy-Weinberg (H-W), y la diferencia génica entre los grupos genéticos. Se encontraron 20 SNP polimórficos. HNF4 ss61961144 y SCD g.10213 no se encontraron en equilibrio de H-W. Los SNP dentro de SCD1 se encontraron en desequilibrio de ligamiento al igual que los SNP dentro de PRKAR2A; DGAT1 K232A, IGF2R ss77831885, MYOZ1 ss77831945, PRKAR2A ss62837580, PRKAR2A ss628376667, SCD1 g.10329, SCD5 134718 y SRPRA 4150, los cuales presentaron diferencia génica entre grupos. En conclusión, SCD1 g.10329 es el marcador con mayor solidez, que presenta diferencia génica entre grupos, por lo que puede utilizarse en selección asistida por marcadores (MAS) para mejorar el perfil de FA en carne, adicionalmente se propone hacer análisis de asociación a FA de SLC2A4 ss62538460, PLTP ss77832104, PPARGC1A c.1892+19 y MYOZ1 ss77831945, debido a que son SNP con cualidades para implementarse en el mejoramiento genético asistido.
n cattle, the AMPK pathway acts as an energy sensor that is activated by increases in the cellular AMP/ATP ratio and influences multiple metabolic processes by modifying the FA profile in different tissues. The objective was to estimate and compare the allelic frequencies of 27 SNP in 22 genes of the AMPK pathway, in Wagyu and Wagyu-cross populations. For this, 111 samples of Longissimus dorsi from Wagyu and Wagyu-cross were collected, and grouped by genetic group, 27 SNP located within the 22 genes that participate in the AMPK pathway were typed, linkage disequilibrium, Hardy-Weinberg equilibrium, and the genetic difference between genetic groups were examined. Within the results, 20 polymorphic SNP were found; HNF4 ss61961144 and SCD g.10213 were not found in H-W equilibrium; SNP within SCD1 were found in linkage disequilibrium as were SNPs within PRKAR2A; DGAT1 K232A, IGF2R ss77831885, MYOZ1 ss77831945, PRKAR2A ss62837580, PRKAR2A ss628376667, SCD1 g.10329, SCD5 134718 and SRPRA 4150 presented genetic difference between groups. As conclusions, SCD1 g.10329 is the most solid marker that presents genetic difference between groups, so it can be used in MAS to improve the FA profile in meat. Additionally, it is proposed to perform association analysis with FA of SLC2A4 ss62538460, PLTP ss77832104, PPARGC1A c.1892+19 and MYOZ1 ss77831945, because they are SNP with qualities to be implemented in marker assisted selection, however, they lack further validation of their reported effect.
