Yasmín Araceli Gálvez Muñoz, Keissy Maleni Palacios-Hernández
, Régulo Ruíz Salazar
, José Abisenas Alvarez Rivera
, Guillermo Castañón Nájera
RESUMEN. El objetivo de la investigación fue analizar la variabilidady agrupación genética de 26 poblaciones silvestres de chile (Capsicumspp.) con cuatro marcadores microsatélites (SSRs). Las secuencias simples repetidas (SSRs) identificaron 278 alelos, 92 fueron polimórficos. El número mayor de alelos (97) fueron identificados por HpmsCa19, y el número más bajolo arrojó el Hpms1-274(53). El Análisis Molecular de Varianza (AMOVA), detectó que 11.16% de la variabilidad se debió a regiones, mientras que el 27.12% se encontró entre poblaciones, en cuanto a individuos dentro de las poblaciones se explicó con el 70.51%. El estadístico PhiRT=0.103 indica que existen diferencias entre regiones, mientras que PhiPR=0.278 indica un exceso de heterocigotos en las poblaciones, en tanto PhiPT=0.352, expresa que los individuos de cada población mostraron efecto moderado de apareamiento no aleatorio. El análisis deconglomerados(clúster)unió a las poblaciones evaluadas en cinco conglomerados.En los clústers IV y V se agrupó el mayor número de poblaciones, siete en el clúster IV y nueve en el clúster V. La población Ojode Cangrejo Sierra (OCS) formó un clúster individual. La estimación de la estructura de las poblaciones evaluadas se determinó a partir de un valor de K=4 y un ∆K =11.76. Con base a los resultados obtenidos, se puede concluir que los marcadores de secuencias simples repetidas (SSRs) son efectivos para identificarla diversidad genética,estapuede usarsecomo fuente de genes para ser incluidos en nuevas variedades para ayudar en la mejora de la producción agrícola y conservación de este importante germoplasma.
ABSTRACT. This research was carried out emphasizing the analysis of the structural genetic diversity of 26 wilds populations of chili (Capsicum spp.), four microsatellite markers were used (SSRs). The SSR markers used, identifying 278 alleles, 92 of them were polymorphic. The highest number of alleles (97) was identified by the primer HpmsCa19, and the lowest number (53) was identified with Hpms-274. The Analysis of Molecular Variance (AMOVA) detected that 11.16% of the variability was due to regions, 27.12% between populations, and individuals within populations the remaining 70.51%. The statistic PhiRT=0.103 indicated that there are differences between regions, PhiPR=0.278 can be interpreted as an excess of heterozygous in the populations, while PhiPT=0.352, expressed that the individuals in each population showed a moderate effect of non-random mating. The conglomerate or cluster analysis united the evaluation between the populations into five groups. In the group ofclusters, IV and V, thelargest union occurred. Seven in conglomerate or group IV and nine in cluster or group V. Population of Ojo de Cangrejo Sierra (OCS) formed an individual group or cluster. The estimation of the structure of the evaluated populations was determined with a value of K=4 and ∆K=11.76. Based on the results obtained in the present study, it can be concluded that the simple sequence repeats (SSRs) markers were effective in identifying genetic diversity found and can be used as source of genes to be included in new varieties to help improve agricultural production and conserve important germoplasm.