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A seleção assistida por marcadores moleculares para tolerância ao frio é de interesse em arroz devido às dificuldades de seleção em condições de campo e ao fato de que a tolerância varia conforme o período de desenvolvimento da planta. O objetivo deste trabalho foi caracterizar a tolerância ao frio de seis genótipos de arroz em diferentes períodos de desenvolvimento, verificar as correlações entre estes períodos e identificar a população mais adequada para o mapeamento da tolerância ao frio com base no polimorfismo de marcadores RAPD e características fenotípicas. A tolerância ao frio foi avaliada nos períodos de germinação, vegetativo e reprodutivo por meio de dez características. Os resultados mostraram que os genótipos Japônica foram mais tolerantes ao frio que os Indica em todos os períodos de desenvolvimento estudados. As correlações fenotípicas variaram conforme a característica considerada e foram superiores quando elas diferenciaram genótipos tolerantes ao frio de genótipos sensíveis. Os coeficientes de Jaccard indicaram um baixo grau de similaridade entre os genótipos Japônica e os Indica, portanto com base nos marcadores RAPD qualquer cruzamento Japônica x Indica seria adequado para o mapeamento da tolerância ao frio. As características fenotípicas, em contraste, não separaram completamente os genótipos e, baseado nisso, a população mais divergente para o mapeamento da tolerância ao frio seria o cruzamento envolvendo o tolerante Quilla 64117 e o sensível IRGA 417.
