Objetivo: Comparar o perfil lipídico, glicemia e pressão arterial com o estado nutricional em adolescentes com o polimorfismo rs2293855 do gene MTMR9. Métodos: Estudo transversal com adolescentes. Dados foram coletados em dois encontros, com intervalo de 15 a 21 dias. No primeiro, foram coletadas células da mucosa oral, aferida a pressão arterial (PA) e coletadas informações como sexo, idade e renda familiar. Exames de lipidograma, triglicerídeos e glicemia foram solicitados. Resultados: Participaram 126 adolescentes, 56,35% do sexo feminino, com média de idade de 14,05±2,32 anos. Do total, 58,8% eram eutróficos, 20,6% com sobrepeso e 20,6% obesos. Houve diferença significativa na idade entre os eutróficos e obesos (p=0,03) e maior histórico familiar de obesidade (p=0,03). Todos apresentaram o alelo de risco (A). Houve diferença significativa nos níveis de HDL-c entre os eutróficos e obesos (p=0,03) e na PA (p<0,05). Conclusão: Houve associação entre HDL-c, PA e estado nutricional em adolescentes com o polimorfismo.